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鱼腥藻PCC7120基因asr0757/alr0758的初步研究

  • 投稿菜鸟
  • 更新时间2015-09-22
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李丽君,陈思礼,马凯,蒋泽凤,周江旭

(中南民族大学生命科学学院,武汉430074)

摘要:为研究鱼腥藻PCC7120(Anabaena sp.)基因asr0757/alr0758在毒素-抗毒素系统中的相关生物学功能,设计了特异性引物,扩增目的片段asr0757和alr0758,将目的基因与pMD18-T载体连接构建克隆载体,并对其进行XhoⅠ和NdeⅠ双酶切,再与表达载体pET-28a连接构建表达重组菌,重组菌的体外表达在IPTG的诱导下进行。经琼脂糖电泳检测,结果扩增出了大小为210 bp的asr0757和342 bp的alr0758目的基因。经SDS-PAGE电泳检测,表达出相对分子质量分别为8.068 kD和12.534 kD的蛋白质。根据结果可初步认定alr0758为毒素基因,asr0757为抗毒素基因,共同构成鱼腥藻PCC7120毒素-抗毒素系统。

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关键词 :鱼腥藻PCC7120(Anabaena sp.);毒素-抗毒素系统;asr0757/alr0758

中图分类号:Q78文献标识码:A文章编号:0439-8114(2015)03-0709-04

鱼腥藻PCC7120的毒素-抗毒素(Toxin-antitoxin,TA)系统是由编码毒素蛋白和抗毒素蛋白的2个基因对共同组成的,毒素蛋白可通过影响细胞的相关生物学功能使其死亡,同时毒素也可能对人类及其他生物体造成威胁[1-4]。研究表明,根据TA系统编码产物的序列相似性可将其分为relBE、mazEF等8个系统家族,且大肠杆菌染色体上的mazEF家族是目前研究最广、遗传背景相对清楚的TA系统之一[5,6]。本试验通过分子生物学分析,对鱼腥藻PCC7120基因asr0757/alr0758进行了相关研究,旨在为该基因在毒素-抗毒素系统中的相关生物学功能的研究提供基础,为治理水华污染和开发高效的蛋白表达系统提供新思路。

1材料与方法

1.1试验材料

1.1.1藻种藻种为鱼腥藻PCC7120(Anabaena sp. PCC7120),由中南民族大学生命科学学院病原分子生物学研究室保存(购于中国科学院水生生物研究所)。

1.1.2主要试剂及仪器克隆载体pMD-18T Vector、限制性内切酶、T4 DNA连接酶(Takara公司),DNA聚合酶(Fermentas公司),琼脂糖凝胶回收试剂盒、质粒DNA提取试剂盒(Axygene公司),E.coli DH5α、E.coli BL21、表达载体pET-28a为本实验室保存,PCR引物合成、克隆载体及表达载体的测序均由南京金斯瑞生物科技有限公司完成。

HZQ-C型空气浴振荡器(哈尔滨市东明医疗仪器厂)、KDC-16H型高速离心机(科大创新股份有限公司中佳分公司)、TGL-16B型台式高速离心机(湖南星科科学仪器有限公司)、SW-CJ-2FD型双人单面净化工作台(苏州净化设备有限公司)、DYY11B型三恒电泳仪(上海金鹏分析仪器有限公司)。

1.2试验方法

1.2.1引物设计与合成以及目的基因PCR为扩增目的基因asr0757及alr0758,先通过NCBI找到鱼腥藻PCC7120的已知基因序列,再利用Oligo 7.0软件设计4条引物:asr0757-F(5′-CCCAGACTGATAACATAC- 3′)、asr0757-R(5′-CCGTAATTTGTCATATTCTGCGTC-3′)、alr0758-F(5′-CCACAAATTATAAATTCGGGGATGTTATC-3′)、alr0758-R(5′-CCGGCCCGCCAAAATAATCTGTAAAAGATTATGTAAC-3′)。下划线部分为酶切位点序列,其中“CATATG”对应NdeⅠ、“CTCGAG” 对应XhoⅠ。通过降落式PCR技术得到大量目的片段,并用DNA回收试剂盒对目的片段进行纯化回收,为后续试验做准备。

asr0757/alr0758 PCR程序:94 ℃ 4 min,1个循环;94 ℃ 1 min,55.5 ℃(0.5↓) /65.5 ℃(0.5↓) 1 min,72 ℃ 40 s,15个循环;94 ℃ 1 min,48 ℃/58 ℃ 1 min,72 ℃ 40 s,25个循环;72 ℃ 7 min,1个循环。

1.2.2重组克隆载体的构建PCR扩增目的片段通过pMD-18T Vector转化到CaCl2法制备的E.coli DH5α感受态细胞中,并通过蓝白斑筛选在氨苄青霉素抗性固体培养基上进行双重阳性筛选,最终挑取白色菌斑进行菌落PCR,通过测序比对,从而确定克隆载体构建成功与否。T-A克隆体系为0.5 μL T载体、3.0 μL PCR纯化产物、1.5 μL ddH2O、5.0 μL溶液Ⅰ。

1.2.3重组表达载体的构建用XhoⅠ和NdeⅠ对重组质粒进行双酶切获取目的基因片段,双酶切体系见表1。通过T4 DNA连接酶将目的片段与表达载体pET-28a相连,连接体系见表2。将连接产物转化入E.coli BL21中,使其在含卡那霉素抗性的固体培养上培养,进行阳性筛选。有菌落白斑长出后,挑菌摇床过夜并取适量菌液测序以确定表达载体是否构建成功。

1.2.4毒素-抗毒素蛋白质的诱导表达将含有重组质粒的菌液接种于新鲜的含50 μg/mL抗生素(卡那霉素)的LB抗性液体培养基中,37 ℃摇床过夜,再取50 μL菌液活化3 h,而后加入IPTG摇床12 h诱导蛋白质表达。对样品进行处理后,用15%分离胶和5%的浓缩胶进行SDS-PAGE电泳检测蛋白质表达的相对分子质量。

2结果与分析

2.1asr0757/alr0758基因的扩增

应用PCR扩增技术扩增asr0757/alr0758基因,并对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,结果表明,基因片段的实际大小与预期大小(210 bp和342 bp)相符(图1、图2)。

2.2克隆载体的构建

PCR扩增后的目的片段通过与pMD18-T载体在4 ℃条件下连接过夜,将连接产物转化到用CaCl2法制备的E.coli DH5α感受态细胞中,进行蓝白斑筛选,挑取阳性单菌落进行菌落PCR检测,将菌液进行测序,结果表明2个目的基因asr0757、alr0758均成功转入(图3)。

2.3表达载体的构建

选取pET-28a上的酶切位点XhoⅠ和NdeⅠ,对克隆重组质粒进行双酶切,并将回收后的目的基因片段连接到表达载体pET-28a上,再转化到大肠杆菌BL21细胞中,挑取阳性单菌落,进行质粒提取及双酶切检测,通过初步鉴定后进行测序。结果表明,表达载体成功构建(图4、图5)。

由图4可知,在asr0757基因表达菌序列比对结果中,配对率为100%,基因覆盖率为98%。图5为alr0758基因表达菌序列比对结果,结果表明其配对率为100%,基因覆盖率为99%。2个基因引物设计时,均敲除了终止密码子。

2.4毒素-抗毒素蛋白质的诱导表达

经测序成功的表达载体重组质粒,在IPTG的诱导下进行体外表达(图6)。结果表明,毒素-抗毒素蛋白质在37 ℃、150 r/min的条件下经IPTG诱导12 h时有蛋白质表达,但alr0758基因表达量较少,且诱导剂本身对细胞生长有一定的毒性作用,所以初步认为其为毒素基因。目的毒素蛋白质、抗毒素蛋白质相对分子质量分别为8.068 kD和12.534 kD,再加上其组氨酸标记及相应的酶切位点,分子量增加约为5 kD,故实际检测到的蛋白质相对分子质量约13.068 kD和17.534 kD。经SDS-PAGE电泳检测,在10~15 kD之间及15~20 kD之间分别有一较为明显的条带,与理论值基本相符。

3讨论

本试验设计了asr0757和alr0758基因的特异性引物,采用降落PCR扩增目的基因构建相应的克隆载体,再利用经测序检测正确的克隆重组质粒来构建表达载体,测序并进行序列比对后表明,目的基因均正确插入到表达载体pET-28a中,且没有任何碱基突变出现,故2个目的基因表达载体均成功构建。在表达载体的构建过程中,载体与目的片段的最佳浓度比例为1∶6~1∶9,此比例下菌落生长状况较好。大于1∶6的比例时,菌落几乎不生长,故载体与目的片段比例的选取是该步骤中的一个重要因素。此外,正常生长的单菌落中,由于载体未完全切开或载体自连等原因产生假阳性,因此必须对重组质粒进行测序以验证试验结果。

含目的基因asr0757的pET-28a-asr0757和含目的基因alr0758的pET-28a-alr0758经IPTG诱导表达,经UniProtKB软件分析可知,蛋白质表达的大小分别为8.068 kD和12.534 kD,再加上5 kD左右的组氨酸标记及相应酶切位点,理论大小为13.068 kD和17.534 kD。SDS-PAGE检测结果表明,目的蛋白质的分子实际大小与理论值基本相符。目的蛋白质在37 ℃、150 r/min条件下培养表达,但其最佳表达条件有待进一步研究。毒素基因alr0758可能具有核酸酶活性,而已有的研究表明,具有核酸酶活性的毒素蛋白质可通过降解mRNA抑制细胞生长[7-10],故其表达量较少。

目前,淡水湖泊的污染形势日趋严峻,而藻类是水体富营养化的主要媒介,且大肠杆菌细胞染色体上TA系统基因参与了一种特殊的环境胁迫应答并介导细菌的程序性死亡[11,12],使得对TA系统的研究具有十分重要的指导意义。本试验成功克隆和表达了鱼腥藻PCC7120染色体基因asr0757和alr0758,并对其相关性质进行了初步研究,为后续的相关试验奠定基础。

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