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荧光定量PCR在病原微生物检测中的应用

  • 投稿菲斯
  • 更新时间2015-10-29
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李 晶

南阳理工学院 河南省南阳市 473004

【摘 要】目的:探讨荧光定量PCR 在病原微生物检测中的应用价值。方法:选取南阳市第一人民医院收治的800 例患者作为研究对象,其中淋球菌(NG)感染206 例,沙眼衣原体(CT)感染358 例,解脲支原体(UU) 感染236 例。使用荧光PCR 检测仪进行检测。结果:研究结果发现CT 检测,阳性例数为38 例,阳性率为10.61%,NG 阳性率为14.08%,阳性率最高,UU 阳性检测率为14.41%,仅次于NG。结论:采用荧光定量PCR 对病原微生物进行检测,可以有效提高检测的准确度,值得推广使用。

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关键词 荧光定量PCR;病原微生物;淋球菌;解脲支原体

荧光定量PCR,是一种新的定量测验技术,这种检测技术有效保留了常规PCR的优势,具有较高的特异性和灵敏性,而且还可以有效降低检测的假阳性率。对此,本院对荧光定量PCR 在病原微生物检测中的应用价值进行了研究,具体研究情况如下:

1 资料与方法

1.1 一般资料

选取南阳市第一人民医院门诊科、泌尿科以及皮肤科收治的患者800 例作为研究对象,其中男性390 例,女性410 例,其中淋球菌(NG)感染206 例,解脲支原体(UU)感染236 例,沙眼衣原体(CT)感染358 例。取这些患者的宫颈、尿道分泌物进行检测。

1.2 检测仪器及工具

在本研究中,使用的检测仪器为美国生产的型号为BIO-RAD iCylcer 的荧光PCR 检测仪,检测中所使用的试剂盒为核酸扩增荧光检测试剂盒。

1.3 检测原理

在进行检测时,在常规PCR 的基础上,添加了荧光双标记探针的使用,在该探针上会标记2 个荧光基团。将其中的一个荧光基团标记在探针的5′端,同时将另一个荧光基团标记在探针的3′端。通过这两个标记可以构成一个完整的能量传递结构。也就是说5′端荧光基团所发出的荧光,能够被另外一端的荧光基团所吸收或抑制。在检测中,无特异性PCR 发生时,探针的荧光信号不会发生任何的变化。但是如果有特异性PCR 扩增发生时,探针会在PCR 检测过程中,Taq 酶的5′到3′外切酶活性作用会将5 探针信号切断,从而导致切下的3′端荧光基团抑制作用会消失,而切下的5′端荧光基团信号会增长[1]。探针的3′端羟基已被去除或封闭,不具有延伸能力。荧光信号会随着PCR 产物的增长而不断增长。

1.4 检测方法

首先使冻存的细胞完全溶解,加入样品处理液,以13000r/min 将标本进行离心,10 分钟后使用RNA 去除掉上清液,完成上述操作后,采用常规碱裂解法将CT、NG、UU-DNA 提取出来。提取完成后,就可以对其进行荧光PCR 检测了。首先将各反应管放入荧光PCR 检测仪上,在不同条件下对其进行扩增,共进行42 次该循环。等到所有反应都结束后,使用电脑对所获得的数据进行分析,并计算出结果。每次检验完成后均需要做阳性和阴性对照。

2 结果

检测完成后,严格按照试剂盒上的说明,对荧光定量PCR 检测的结果进行分析,研究结果发现CT 检测,阳性例数为38 例,阳性率为10.61%,NG 阳性率为14.08%,阳性率最高,UU 阳性检测率为14.41%,见表1。

3 讨论

病原微生物种类众多,会对人的机体造成巨大影响,其中,淋球菌(NG)、解脲支原体(UU)、沙眼衣原体(CT)都是非常常见的病原微生物,患者一旦感染上这些病原微生物,会对患者的健康造成很大影响,因此,提高对病原微生物诊断的准确性具有非常重要的临床意义,可以为临床的诊断和治疗提供重要的参考作用[2]。传统对病原微生物的检测主要是通过细菌培养、细菌涂片等方式进行检测,但是这些检测方法的检测率普遍较低,且所需周期较长,会影响患者的及时治疗。

PCR 检测技术的应用在一定程度上提高了检测的准确率,早期的PCR 检测技术虽然弥补了传统检测方式的不足,但是还是存在假阳性较高等问题,无法有效发挥对临床治疗的指导作用。随着PCR 检测技术的不断发展完善,荧光定量PCR 的检测能力更强,灵敏性和特异性都较好,能够正确指导临床做出诊断,是临床治疗的重要参考,因此,应进一步加强其在临床诊治中的应用。

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参考文献

[1] 叶自霞, 杨俊, 聂福平, 王昱, 袁曾壮, 李应国, 王国民, 李贤良, 保雨,刘亚娟, 刘力. 家畜嗜衣原体TaqMan-MGB 荧光定量PCR 检测方法的建立[J].中国兽医科学,2015(04):380-384.

[2] 赵洁, 马晨, 席晓敏, 张和平. 实时荧光定量PCR 技术在肠道微生物领域中的研究进展[J]. 生物技术通报,2014(12):61-66.

作者简介

李晶(1983-),女,河南省南阳市人。大学本科学历。现为南阳理工学院助教。研究方向为生物医学。